• PNA探针类型

       无标记的PNA

       -N端的游离胺

        – N端的乙酰化作用

       带标记的PNA

         -N端和C端标记

          -双标记

        修饰PNA

        氨基酸修饰其他适当的官能团修饰

       Alpha 或Gamma PNA

       -多标记的PNA骨架

       -PNA骨架的附加功能

  • 设计指南

       1. PNA有很好的亲和力一般只需13~18个碱基即可。

       2. 富含丰富的嘌呤碱基的序列有聚集现象且溶解度降低。

          -嘌呤碱基含量限于80%(建议不要超过60%)

          -嘌呤碱基伸展最好不要超过5个

       3. 为增加溶解度可以在碱基序列中增加O linker (eg linker), E linker, X linker, 赖氨酸等溶解度促进因子。

       4. PNA的N端标记时,为避免杂交时标记分子的影响在PNA和荧光标记中间添加O linker等。

       5 . PNA的C端标记是,C端的末端加入赖氨酸或者L-半胱氨酸后加标记。

标记物种类

标记

λads(nm)

λem(nm)

标记

λads(nm)

λem(nm)

FAM,FITC

492

518

OregonGreen488

498

526

TAMRA

553

576

AlexaFluor488

494

517

TexasRed

592

614

AlexaFluor532

530

555

TO

510

530

Cy3

550

570

Dabcyl

454

Cy5

650

670

此外还有很多种类的荧光标记物,具体请咨询。